Nesse vídeo, analisaremos as interações e a complementariedade molecular existente entre o fármaco Amprenavir e o seu alvo molecular, a enzima protease do HIV. Essa análise será feita por meio do programa gráfico WebLab Viewer Lite (v 4.2, Accelerys Inc 2001), onde serão geradas diferentes representações do alvo, do ligante e do complexo fármaco-alvo molecular. Além disso, serão medidas distâncias interatômicas entre o fármaco e os aminoácidos importantes para o processo de reconhecimento molecular, bem como serão geradas superfícies de potencial eletrostático do complexo, visando inferir uma possível correlação entre o padrão de complementariedade e a afinidade do fármaco.
Para fazer o download do WebLab Viewer Lite (v 4.2, Accelerys Inc 2001)
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Links e referências:
1 – PDB ID: 3EKV – https://www.rcsb.org/structure/3ekv
2- King NM, Prabu-Jeyabalan M, Bandaranayake RM, et al. Extreme entropy-enthalpy compensation in a drug-resistant variant of HIV-1 protease. ACS Chem Biol. 2012;7(9):1536-1546. doi:10.1021/cb300191k
3 – Para busca no PDBSum: http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/cgi-bin/pdbsum/GetPage.pl?pdbcode=index.html
4 – Tavares, M.T. et al. INTERAÇÕES FÁRMACO-RECEPTOR: APLICAÇÕES DE TÉCNICAS COMPUTACIONAIS EM AULA PRÁTICA SOBRE A EVOLUÇÃO DOS INIBIDORES DA ENZIMA CONVERSORA DE ANGIOTENSINAQuim. Nova, Vol. 38, No. 8, 1117-1124, 2015. http://dx.doi.org/10.21577/0100-4042.20170513
Profa. Dra. Marcelle de Lima Ferreira Bispo
Professora Adjunta do Departamento de Química da Universidade Estadual de Londrina (UEL). Possui experiência na área de Química Medicinal, com ênfase em planejamento, síntese, modelagem molecular e avaliação biológica de novas substâncias com potenciais atividades antibacteriana, antimicobacteriana, antifúngica, antichagásica, antileishmania, antimalárica e antitumoral.
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